Método Geométrico para Análise e Visualização de uma Sequência de DNA

Autores

1763
Luciana Gonçalves Roque
746,385
1764
Rubem Pinto Mondaini
(Orientador)
746,385

Informações:

Publicações do PESC

Título
Método Geométrico para Análise e Visualização de uma Sequência de DNA
Linha de pesquisa
Otimização
Tipo de publicação
Dissertação de Mestrado
Número de registro
Data da defesa
14/5/1999
Resumo
PESC: Resumo de Dissertação de Mestrado Resumo da Tese apresentada à COPPE/UFRJ como parte dos requisitos necessários para a obtenção do grau de Mestre em Ciências (M.Sc.)

Método Geométrico para Análise e Visualização de uma Sequência de DNA

Luciana Gonçalves Roque

Maio/1999
Orientador: Rubem Mondaini  

 
Programa: Engenharia de Sistemas e Computação

      O objetivo deste trabalho é o estudo de uma sequência de DNA pelo método geométrico das Z-curvas. Usamos como exemplo a análise do genoma de uma bactéria - Mycoplasma genitalium. Foi feita uma atenção especial aos genes da família de proteínas Heat Shock de modo a obter seu padrão característico. Indicamos a possibilidade de classificar genes associados a proteínas hipotéticas do mesmo genoma, como pertencentes à família Heat Shock.

Abstract
PESC: Master Degree Abstracts Abstract of Thesis presented at COPPE/UFRJ as a partial fulfillment of the requirements for the degree of Master of Science (M.Sc.)

Hidden Markov Models and their Applications to Protein Modeling

Luciana Gonçalves Roque

May/1999
Advisor:Rubem Mondaini  
Department: Systems Engineering and Computer Science

      The aim of this work is the study of a DNA Sequence through the geometrical method of Z-curves. We take as an example the analysis of the genome of a bacteria - Mycoplasma genitalium. A special care was given to the genes of the Heat Shock Protein family in order to obtain its characteristic pattern. We point to the possibility of classifying the genes associated to hypothetical proteins of the same genome as belonging to the Heat Shock family.

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