Método Semi-Rotulado para Apontar IdentificaçõesConfiáveis em Experimentos de Proteômica Shotgun

Em proteômica, o método padrão ouro para apontar identificações protéicas confiáveis por espectrometria de massa utiliza uma ferramenta de identificação (e.g., SEQUEST, ProLuCID) juntamente com uma base de dados de sequências de proteínas reais (target) e inexistentes (decoy). As sequencias decoy visam modelar um discriminador a partir de scores obtidos da uma ferramenta de busca. Em seguida, as identificações são ordenadas de acordo com uma distância da superfície de decisão do discriminador e, em geral, é aceita uma fração de 1% de identificações falsas (decoys) no resultado final. Neste cenário, acredita-se que outros 1% de espectros de massa identificados como target são falso-positivos. Neste trabalho, primeiramente mostramos uma falha no método padrão ouro: o resultado real pode não ser condizente com o erro predito; em seguida mostramos como determinar quando esta limitação ocorre e como remediá-la.