Gerência de Workflows Científicos: uma análise crítica no contexto da bioinformática
Autores
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1779,1780,936,1781,51
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Fabio Coutinho da Silva
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Sérgio Manuel Serra da Cruz
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Informações:
Publicações do PESC
Título
Gerência de Workflows Científicos: uma análise crítica no contexto da bioinformática
Linha de pesquisa
Engenharia de Dados e Conhecimento
Tipo de publicação
Relatório Técnico
Número de registro
ES-716/8
Data
2/2008
Resumo
Esse relatório técnico tem por objetivo apresentar as principais características de sistemas de gerência de workflows (SGWf) no apoio a experimentos científicos. SGWf vêm sendo utilizados há algum tempo no contexto de aplicações comerciais. Mais recentemente, experimentos científicos desenvolvidos em larga escala vêm necessitando de um controle sistemático, reprodutível e documentado. Assim, SGWf vem surgindo como uma solução importante, desde que devidamente adaptados ao contexto científico. Assim, esse relatório descreve os principais conceitos e requisitos dos workflows científicos, apresenta alguns sistemas disponíveis e aplicações reais em bioinformática e discute os desafios face às tecnologias existentes.
Abstract
This technical report aims at presenting the main concepts of Workflow Management Systems (WfMS) focused on scientific experiments. WfMS have been long used in business processes. Recently, the large scale of scientific experiments is requiring a support to provide systematic control, reuse and documentation for these experiments. WfMS is been pointed as an important technology for such support when adapted for scientific requiriments. Thus, this report presents the main concepts and requiriments of scientific workflows, describes some avaiable WfMS for scientific applications and shows real bioinformatics experiments while discussing the main challenges faced by current technology.
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